正文太虚理气天地阴阳歌五行质气生克制化歌运气合脏腑十二经络歌主运歌主气歌客运歌客气司天在泉间气歌运气分主节令歌五音主客太少相生歌五运齐化兼化六气正化对化歌六十年运气上下相临歌起主客定位指掌歌天符太乙天
原序潘序周序十药总论甲字十灰散乙字花蕊石散甲乙二方论丙字独参汤丙字人参汤论丁字保和汤戊字保真汤丁戊二汤方论己字太平丸己字太平丸论庚字沉香消化丸庚字消化丸论辛字润肺膏辛字润肺膏论壬字白凤膏癸字补髓丹平胃
上卷临症以验舌为准统论验舌分虚实法验舌分阴阳法验舌分脏腑配主方法验舌决生死法临症以验舌为准结语下卷方略泻火清肝饮方滋水生肝饮方逍遥散加生地薄荷方逍遥散加丹皮山栀方十味温胆汤去枳实方当归建中汤去胶饴方七
序卷之一脉经序学诊例总论脉式三部分位六经所属五脏所属五脏本脉体六经本脉体五脏传变病脉六经中伤病脉五用乖违病脉脉偶名状七表病脉八里病脉九道病脉卷之二太医习业五科凡例纪用备论脏腑配天地论三因论外所因论叙中
救自缢良方救溺死救冻死救五绝救诸伤伤眼耳中毒箭鸟枪伤汤火伤诸物咬伤救诸毒物性相反误食伤人水毒避蛊毒挑生毒吞鸦片烟毒野芋毒
原序卷之一一·条令二·检覆总说上三·检覆总说下四·疑难杂说上卷之二五·疑难杂说下六·初检七·覆检八·验尸九·妇人附·小儿尸并胞胎十·四时变动十一·洗罨十二·验未埋瘗尸首十三·验坟内及屋下攒殡尸十四·验
内外伤寒辩惑论
经症十八问胎前三十四问产后三十四问杂症四十三问
自序白苔舌总论黄苔舌总论黑苔舌总论灰色舌总论红色舌总论紫色舌总论霉酱色苔舌总论蓝色苔舌总论妊娠伤寒舌总论
经络统序原始脏腑联系分合详说脏腑联系分合详说手太阴肺经（左右共二十二穴）手阳明大肠经（左右共四十穴）足阳明胃经（左右共九十穴）足太阴脾经（左右共四十二穴）手少阴心经（左右共十八穴）手太阳小肠经（左右共